孩子反复咳嗽3个月，首先考虑是慢性咳嗽，多见于以下几种疾病，1是咳嗽变异性哮喘，本病是哮喘的一个类型，与过敏有关，主要表现是晨咳及夜咳，运动后咳嗽加重，无气喘表现，建议可查一下过敏原及肺功能，治疗方面可给予沙丁胺醇及布地奈德雾化吸入，同时口服孟鲁司特钠咀嚼片4mg，1次/日(睡觉前服用)，可先用1周，如治疗有效，基本就可以诊断本病了，需在当地儿童医院呼吸科定期随诊，调整治疗方案，本病强调个体化，规范化的治疗，2是支气管异物，孩子咳嗽时间长，建议必要时在当地儿童医院行胸部三维重建CT或支气管镜排除，3是支衣原体感染，建议可化验肺炎支原体及衣原体IgM，如果阳性，可加用阿奇霉素进行序贯治疗。希望我的建议对你有所帮助！