多数疣患者在发病1～2年内自行消退，不少患者即使采用深度破坏性方法，有1/3疣仍复发，因此需慎重选择，对一些能造成永久性瘢痕的疗法，不宜使用。药物治疗氟尿嘧啶软膏；博莱霉素皮损内注射；0.7%斑蟊素；0.1%～0.3%维A酸酒精溶液；3%酞乙胺软膏或3%酞乙胺二甲基亚砜搽剂；0.5%鬼臼毒素；5%咪喹莫特霜；抗病毒药；其他，水杨酸，普鲁卡因等均有报道。干扰素、转移因子、胸腺肽等免疫增强剂，全身或疣体注射。光动力学疗法系统或局部外用光敏剂，光照后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣。物理疗法冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣和跖疣。