跑步后小腿骨头出现疼痛的原因非常多，可能和下列几个因素有一定关系：第一、膝关节局部出现滑膜炎，主要是因为长期穿高跟鞋或者是膝关节慢性损伤所引起的；第二、小腿骨头出现急性牵拉挫折，患者如果长时间没有锻炼，又突然性锻炼，就会导致小腿骨质拉伤。第三、长期慢性劳损。