主要区别是检查方式不一样，脑电图是电波检查，核磁共振室影像学检查，脑电图和核磁共振是两种完全不同的检查手段。核磁共振可以检查脑部是否有占位或者是异常病灶，脑电图是用来检测脑部是否存在异常放电，两者检查方式和针对方向都是不同的。脑电图和核磁共振都没有辐射，不会对孩子造成影响。