脑脊液检查是有一定疼痛的，但是这种疼痛可以忍受。需要做背部的穿刺检查，抽取脑脊液，来确定疾病的具体类型，对于头痛有可能是脑炎，脑膜炎，神经性头痛，所以建议做个头颅ct检查，脑脊液的化验检查，然后针对性的治疗，如果是有脑炎或者脑膜炎，那就需要住院治疗比较好，是可以逐渐恢复的。