月经量少头疼的原因有很多，可能是女性的身体内激素出现了紊乱，出现月经失调的情况，也有可能是平时生活中不良的饮食习惯，或者长期生活在阴冷潮湿的地方，卵巢功能不健全，子宫内膜有结合等症状引起的，如果患者平时月经量正常，但是这个月月经量突然很少的话，可能是阴道异常出血，出现这种情况要及时去医院进行检查治疗。