怀孕3个月头疼有可能是病毒感染所导致的，这个时候应该多喝热水，多注意自己的休息时间，注意观察自己的病情变化。内分泌发生变化可能心情，胃口等方面都会发生改变，出现发热和呕吐的症状应该及时到医院进行就诊，及时治疗自己的病状。