区别是检查疾病不同，而且位置也是不一样的。腰穿主要是通过抽取脑积液来进行检查，需要通过病原学来确诊，适用于脑炎或者是脑膜炎患者检查，做检查时候需要放松心态，尽量不要过于紧张，还需要积极配合医生。骨穿是属于骨髓穿刺术简称，是通过抽取骨髓液来检查，所以这是两种完全不同的检查。