磁共振不能完全排除脑炎，脑炎诊断的金标准是病原菌检查和脑脊液定量测定。脑炎可以是细菌性脑炎、病毒性脑炎、结核性脑炎，在影像学上的表现都比较相似，基本上都表现为长t1长t2改变，病灶周围可见不同程度的水肿。在早期的时候，没有发生细胞毒性坏死之前，磁共振检查可以是正常的，但是在脑脊液中可能已经有病原菌的存在了。