替加环素在怀孕期间不能使用，也不能给婴幼儿使用，会引起牙齿变色。不能治疗病毒感染，只能是治疗细菌性的感染。不能间断性的用药，如果用药的疗程不足，会增加其抗药性，影响治疗的效果。对于肾功能紊乱需要做血透的患者，不需要调整剂量。常见的副作用是恶心、腹泻和呕吐，治疗期间不要吃刺激性的食物，以免加重胃部不适。