卵圆孔未闭和房间隔缺损的区别如下：1、这两种病的病因是不同的，卵圆孔未闭是由于孕期营养不良导致的，房间隔缺损是由于孕期基因突变导致的。2、严重程度不一样，卵圆孔未闭缺损一般小于5毫米，房间隔缺损的话缺损部位一般大于5毫米。3、症状不一样，卵圆孔未闭一般没有什么症状，房间隔缺损会有胸闷，心慌，呼吸困难等症状。