新生儿心脏有个小孔自愈可能会需要2到3年左右的时间，具体的时间需要根据宝宝的发育状况进行决定。需要密切观察宝宝的状况，一般需要间隔一段时间到医院配合医生进行心脏彩超检查，能够明确心脏局部的愈合状况。有必要的情况下可以配合医生通过微创手术的方式进行修复。