新生儿脂肪酸代谢异常一般是比较严重的。新生儿脂肪酸代谢异常多数是先天性遗传代谢性疾病所造成的，可能会对肝功能或者是肾功能造成影响，也可能会影响葡萄糖在体内的代谢，从而造成糖尿病或者是低血糖等症状，也会导致心脏功能受到影响，所以属于比较严重的病情。要及时到医院进行检查，根据临床症状来选择合适的治疗措施。