患者在皮下注射粒细胞刺激因子后，骨髓造血功能活跃，部分患者可能会出现骨骼胀痛的症状，有些患者会出现纳差、食欲不振等表现。最为关键的副作用是粒细胞刺激因子在刺激正常粒细胞分化的过程中，也会促进白血病细胞增殖，所以可能会加速急性髓系白血病患者病情进展，或者导致急性白血病患者治疗后复发。