由于真菌性的尿路感染和细菌性的尿路感染的症状表现差不多，都有尿路刺激症状，不容易区分，所以可以首先给予消炎药抗感染治疗，如果无明显疗效，则怀疑是真菌性尿路感染。但是还需要做进一步的检查，比如做导尿后尿液真菌定量培养，如果是阳性，则确定是真菌感染。也可以采取经膀胱镜、尿道取组织活检，有助于确诊。