精子头部缺陷如果已经达到百分之九十九还是比较严重的，这意味着镜子的畸形率非常之高，所以生育功能已经到了比较差的地步，基本上是不会让妻子怀孕的。在这样的前提下，建议男性应该在医生的建议下积极进行治疗，并且改掉日常生活中吸烟、喝酒等恶习，以便尽量提高精子的质量，让生育能力得到进一步增强。