脑干损伤的临床表现与受损的严重程度有关系，首先表现为意识障碍，患者出现昏迷；脑干损伤可以引起瞳孔的改变以及眼球活动异常表现，比如双侧瞳孔不等大等圆、眼球下斜等；出现去皮质强直，伸肌张力增高、头部后仰呈角弓反张等；出现锥体束征，比如肢体瘫痪、腱反射亢进、出现相关的病理反射等。