治疗胃肠炎的药物很多，一般情况下，患者可以服用阿托品等解痉的药物，能够缓解腹痛、恶心症状。也可以服用蒙脱石散、活性炭等药物，有一定的吸附作用，可以减轻腹泻的症状。并且要根据感染病原菌的不同，选择有效的抗生素或者是抗病毒的药物进行治疗。如果出现水电解质和酸碱平衡紊乱，需要及时的进行纠正。