新生儿小肠坏死是非常严重的一种疾病，甚至能够危及到生命，而积极的治疗有可能完全治愈，也有可能留下一些后遗症。其中最常见的后遗症是影响肠道的功能，导致消化不良，表现为反复的便秘或者腹泻，以及出现孩子严重的营养不良导致消瘦、发育迟缓等，特别是做过肠切除的孩子，更容易出现。此外还可以出现肠粘连，引起以后反复的腹痛、腹胀等。