有的患者在吃结石通胶囊的时候会因为药物刺激的反应，出现腹泻、腹胀、腹痛有的时候可能会导致排便异常等。而且有的人长期服用会出现肝功能损坏、肾功能异常等，主要是因为跟个人的体质有关。一般患有慢性患肾病和肝病的患者副作用的发生率会大一些，在用药期间一定在医生的指导下用药。