自体移植和异体移植，最主要的区别就是在排斥反应方面。自体移植的组织器官与受体的抗原性完全相同，相容性比较大，一般不会发生明显的排斥反应。异体移植的组织器官与受体的抗原性存在一定的差异，比较容易出现排斥反应。这就造成了自体移植的成功率，要高于异体移植的成功率。