化脓性藏毛囊肿一定要手术。但也是根据患者的病情来决定的，因为如果患者的藏毛囊肿太小了，那么手术是不容易切干净的。但是如果患者的藏毛囊肿很大，那么是需要立即进行手术的，以免病情出现持续性的恶化。因为化脓性的藏毛囊肿，是很容易恶化，而且还会引发疾病。