甲沟炎化脓以后使用的药物主要是一些抗菌素类药物，包括外用的药物和全身使用的药物。一般情况下，炎症不是很严重时以外用药物为主，可以先用碘伏消毒后外涂夫西地酸软膏或者是磨莫匹罗星软膏进行治疗。如果炎症比较严重，就应当口服克拉霉素胶囊或者头孢呋辛酯等药物进行治疗。