一般不会自愈，通常需要听从医生指导使用抗菌药物进行治疗，如若不经过及时治疗，有可能会导致病情加重。粪肠球菌感染，通常会引起尿路感染或者败血症的情况，也有可能会引起心膜炎或者盆腔感染的现象。因此在受到粪肠球菌感染时，最好到医院进行检查就诊。同时在治疗期间也要注意个人清洁卫生。