肚脐上三指的位置，一般就是十二指肠的部位。另外，胰腺或者胃的下端，也会在这个部位出现。如果患者早晨起床以后，在肚脐上三指的部位出现疼痛感，一般都考虑与十二指肠溃疡有关。另外，也可能与胃溃疡、胃炎等疾病有关。需要患者到医院就诊，完善胃镜检查，才能确定具体的疾病。