想要彻底根治就要在医生指导下通过手术切除方法治疗，输卵管系膜囊肿主要是因为病原体感染引起的，局部发生的水肿属于一种良性病变，假如囊肿比较小的时候，没有症状也没有影响到女性生育，可以先观察一段时间。但影响到了患者生育以及自身健康，就要通过手术切除方法来治疗。