中医治疗主要是囊肿体积比较小，没有影响膝关节屈伸活动和压迫周围血管神经的情况下才可以。腘窝囊肿的中医治疗主要是通过保守治疗，使用活血化瘀作用的中成药物，来促进血液循环，促进膕窝囊肿消退。囊肿体积较大时会影响膝关节屈伸活动，压迫周围重要血管神经。需要通过手术治疗。