腘窝囊肿不治疗可能会使患者出现囊肿体积增大、活动受限的症状，部分病情比较严重的，也有可能会影响日后的工作和生活。当患者确诊为腘窝囊肿以后，需要及时去医院进行治疗，一般可以通过外科手术的方式进行治疗，直接将腘窝囊肿切除掉，防止再次复发。术后还要服用一些消炎类的药物进行治疗，以免出现感染的情况。