直肠囊肿有时不产生明显症状，仅仅是在行结肠镜检查时偶然发现，发现后可以在内镜下给予切除处理，如果直肠囊肿引发了症状，往往表现为腹泻、腹痛，有时会出现轻微的头痛脑胀等情况，直肠囊肿较为庞大时，有时很难在肠镜下切除，需要行开放性或者腹腔镜手术治疗。