藏毛囊肿手术不会痛苦，在手术的时候医生都会给予麻醉，可以选择局部麻醉或者是全部麻醉。因此在手术的过程中并不会感到痛苦，但是在麻醉药物失效后，可能会导致手术部位出现疼痛感。藏毛囊肿可能是先天因素所造成的，并且跟局部损伤也有着密切的关系。这是一个小手术，要放松心情，避免情绪紧张。