肩部关节镜手术的危害主要是在肩关节镜手术的时候，有可能对其他的部位造成损伤，而且手术以后因为剥离的范围比较大有可能造成肩关节的粘连，会引起肩关节的广泛疼痛和肩关节活动受限，所以手术以后需要在康复师的指导下进行康复训练，避免关节局部的僵硬，将来影响肩关节功能。