两者的主要区别是腹部肌肉疼痛一般是酸痛，而内脏疼痛属于一种绞痛，两种性质不同。引起腹部肌肉疼痛的原因很多，常见的有肌肉拉伤、胃肠功能紊乱以及慢性咳嗽，都会出现肌肉酸痛的症状，而内脏疼痛一般常见于急性胆囊炎和急性阑尾炎，有些患有肿瘤性病变的患者也会出现腹部胀痛。