骨囊肿一般会越来越重，长时间的存在甚至出现变性。少数轻微的外伤出现病理性骨折，影响机体功能。需要手术治疗，较小的囊肿在刮除囊壁后植入骨水泥，囊肿较大会引起骨质强度下降，需要植入自体的松质骨，促进骨质的生长。部分需要植入钢板增加骨质的强度，避免出现骨折造成骨质生长缓慢。