背部两个肩胛骨中间疼通常和以下因素有关：1、患有脊柱关节炎或者是强直性脊柱炎。2、背部脊柱棘上韧带出现炎症或者是劳损。3、骨质疏松或者是胸椎肿瘤。4、胸椎出现感染或者是胸椎结核以及胸椎骨折和背部软组织挫伤等。由于导致内部肩胛骨中间疼的原因比较多，所以这种情况建议去医院做检查，医生会根据情况来进行治疗。