怀孕期间有褐色的分泌物，但是肚子没有疼痛感，是要结合怀孕的周数分析可能的原因。怀孕两个月的孕妇出现这种表现，一般都为先兆流产的症状。引起褐色分泌物的原因，可能是胚胎的发育异常或者是体内的孕激素水平过低，也可能是子宫内膜发生了炎症性病变。应当尽快到医院去进行实验室检查及超声检查，明确诊断后治疗。