过氧化氢抑菌洗剂的效果因所患疾病的具体性质不同而有区别。过氧化氢抑菌洗剂实际上就是一种外用的消毒洗涤剂，可以对厌氧菌的生长和繁殖起到抑制作用。对于因为厌氧菌感染引起的阴道炎和外阴炎，可以起到辅助治疗的效果。对于需氧菌引起的感染性疾病则没有效果。