一般不会引起腰部疼痛，出现腰部疼痛，可能是腰间盘突出引起的，也可能是过度劳累导致的，需要通过影像学检查做进一步确诊，根据检查结果做针对性治疗。巧克力囊肿通常会表现为盆腔疼痛和痛经，并且还会伴随着性交通，有少数女性还会出现月经异常或者是不孕不育。需要在医生指导下口服非甾体抗炎药物进行治疗。