做阴道超声月经刚干净不可以做的，最好是等月经干净的三天左右，可以到医院做一下阴超的检测，出现阴道疼痛可能是患有宫颈炎症以及阴道炎疾病而引起的，宫颈炎症通常是由于感染了葡萄球菌，或者是大肠杆菌以及念珠菌等细菌而引起的，通常会伴有阴道疼痛、瘙痒以及尿路感染、尿急、尿频等情况。