服用了黄体酮后月经总是不干净，考虑是由于服用黄体酮的方法不正确。如果因为月经不来而服用黄体酮调经，一般都是在服药3~5天后就要及时的停药，这样的话在停药3~5天左右来了月经，持续3~5天左右就能干净。如果来了月经以后仍然继续服用黄体酮胶囊，子宫内膜的剥脱不彻底，就会出现月经总不干净的现象。