有卵巢囊肿6厘米，月经干净后去检查卵巢囊肿变小，可能是月经干净后的原因，有的卵巢囊肿受月经的影响，在月经来潮之前会体积大一些，月经干净后体积会小一些。但是体积已经达到了6厘米，一般不会不是生理性的，需要按照医生的建议做好定期复查。如果在短时间内增长的速度比较快，或者是有其他的异常情况，需要及时采取相应的治疗措施比较好。