停药后两天能不能同房，主要与个人用药的原因有关。如果患者是因为患有阴道炎而使用药物治疗，停药两天的情况下建议暂时不要同房。应当在停药3~7天后到医院进行白带常规检查，评估治疗效果。如果已经完全病愈，则可以恢复性生活，如果还没有完全病愈，需要继续下一个周期的治疗。