宫颈囊肿一般是不会自动消失的。宫颈囊肿是慢性宫颈炎的一种表现，是因为炎症刺激导致宫颈部位的粘液腺腺体的管口被堵塞，里面的分泌物排不出来而形成的潴留性囊肿。因为被堵塞的宫颈腺腺管口是不能自动恢复正常的，宫颈囊肿也就不能自动消失。