巧克力囊肿最佳的治疗方法是手术治疗，一般通过微创手术治疗，能够彻底治疗病情，而且手术之后病情反复的可能性比较低。先看看经期的变化，如果总是出现痛经，经期失调等现象，对正常的生活和以后的怀孕影响都比较大，可以适当的用药调理看看。平时不要着凉，注意手术后及时做全面复查。