怀孕40天的时候可以吃药物流产。比较适合做药物流产的怀孕天数，是在35天到49天之间。在这个时间段内，妊娠囊与母体子宫之间的联系不紧密，服用药物流产后比较容易流产成功。在做药物流产之前，需要先到医院做超声检查，进一步确定妊娠的天数和妊娠囊所在的位置。