同房两天以后可以去做阴超检查。但是如果是检查是否怀孕，这个时间检查不出来。建议您同房七天以上，去医院抽血化验hcg，就能够准确的确诊是否怀孕了。如果没有其他次的性生活排除怀孕以后，小肚子疼痛的症状有可能是月经前痛经症状，也有可能是由于妇科炎症而引起的，建议月经干净后3至7天内去医院检查确诊。