菌群失调是有可能会自行恢复的，不过在此期间需要注意不可以同房，同时还要注意阴道部位的清洁和卫生，防止发生感染，经过一段时间以后，阴道中的乳酸杆菌就会有所增多，这样菌群失调的现象就会有所改善。不过如果因为菌群失调而导致了阴道炎症，就要进行有效的治疗，通常不会自行恢复。