月经过后中期腰酸肚疼一般是由于身体体虚造成的，在月经过后出现金亏，血少的情况就会造成肾虚腰疼，此外也有可能是一些妇科疾病感染所致的，比如常见的宫颈炎，盆腔炎等疾病，这个时候就需要做相关的妇科检查或者是宫颈刮片细胞学检查，确定病情如有需要，可以进行抗炎抗治疗。