女性在排尿时有小肚子疼的症状，很可能是膀胱炎，或者是尿道炎导致的。患者可以去医院进行尿液常规的检查，主要是观察白细胞的情况。如果存在炎症，可以使用对应的抗生素来进行治疗。另外，如果女性做过剖宫产手术，就有可能导致切口与膀胱粘连，而当膀胱变得充盈时，就会导致腹部出现疼痛。