怀孕六周的时候会出现有褐色分泌物的这种情况，可能是因为患上了慢性宫颈炎之类的妇科炎症而导致的，需及时的在医生的指导下进行抗炎治疗。除此以外，先兆流产宫外孕或者是服用了某种药物，也会导致此种现象的发生。建议最好是去医院检查一下，并在医生的指导下采取合适的手段保胎。