一般是炎症的原因，还有可能是出现了尿路结石或者肿瘤疾病引起的。女性尿道有褐色分泌物，可以到医院通过膀胱镜检查确诊，要根据检查结果遵从医生指导积极的进行治疗，若是炎症引起的，可以服用抗炎的药物治疗，如果是尿路结石或者是肿瘤疾病引起的必要时，还需要进行手术治疗。